More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1333 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  94.74 
 
 
248 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  87.1 
 
 
248 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  76.52 
 
 
248 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  75 
 
 
249 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.71 
 
 
277 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  65.31 
 
 
247 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  64.23 
 
 
247 aa  328  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  64.49 
 
 
264 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  64.49 
 
 
264 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  63.27 
 
 
247 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  63.27 
 
 
247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  63.27 
 
 
247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  61.22 
 
 
247 aa  315  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  64.38 
 
 
236 aa  314  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  64.81 
 
 
236 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  59.76 
 
 
248 aa  304  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  60 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  59.18 
 
 
248 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  58.78 
 
 
248 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  58.78 
 
 
248 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  58.78 
 
 
248 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  58.78 
 
 
248 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  58.78 
 
 
248 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  60.57 
 
 
248 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  59.18 
 
 
248 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  58.2 
 
 
251 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  57.61 
 
 
246 aa  298  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.79 
 
 
246 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  58.13 
 
 
248 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  58.13 
 
 
248 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  58.13 
 
 
248 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  57.72 
 
 
248 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  56.5 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  56.28 
 
 
248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  56.2 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  54.66 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  59.92 
 
 
249 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
260 aa  277  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  55.51 
 
 
246 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  275  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.33 
 
 
245 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  274  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
246 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  54.69 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.09 
 
 
246 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.1 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.09 
 
 
244 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.32 
 
 
245 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.87 
 
 
245 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  51.22 
 
 
252 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.92 
 
 
241 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.46 
 
 
245 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.69 
 
 
245 aa  262  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.09 
 
 
245 aa  261  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.24 
 
 
249 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.51 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.05 
 
 
245 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.24 
 
 
248 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
248 aa  255  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 
242 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 
242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  53.91 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.64 
 
 
245 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  53.31 
 
 
242 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  52.05 
 
 
241 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 
241 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  50.41 
 
 
240 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
247 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 
246 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.41 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
242 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.41 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.64 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  48.98 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  48.98 
 
 
247 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
240 aa  242  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 
242 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  52.87 
 
 
242 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  52.48 
 
 
240 aa  241  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>