More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5342 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  74.07 
 
 
246 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  69.8 
 
 
247 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  68.57 
 
 
247 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  72.43 
 
 
246 aa  370  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  69.39 
 
 
247 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  68.57 
 
 
247 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  68.98 
 
 
277 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 
264 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 
264 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  66.12 
 
 
247 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  65.71 
 
 
247 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  67.37 
 
 
236 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  67.8 
 
 
236 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  60.73 
 
 
248 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  61.13 
 
 
248 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  61.13 
 
 
248 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  59.26 
 
 
248 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  59.51 
 
 
249 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  59.59 
 
 
248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  57.83 
 
 
248 aa  307  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 
248 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 
248 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 
248 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 
248 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  57.43 
 
 
248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  57.32 
 
 
248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  58.37 
 
 
248 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  57.38 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  58.3 
 
 
248 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  58.2 
 
 
248 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  55.92 
 
 
248 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  55.92 
 
 
248 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  57.38 
 
 
248 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.96 
 
 
249 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  57.37 
 
 
249 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
246 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  55.74 
 
 
246 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  55.33 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
248 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
260 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  58.3 
 
 
248 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
246 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
246 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  53.88 
 
 
247 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  54.51 
 
 
246 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.92 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  54.92 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.74 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
246 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  56.38 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.69 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  56.38 
 
 
241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 
241 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  56.79 
 
 
241 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.29 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.14 
 
 
241 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.1 
 
 
245 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  55.56 
 
 
241 aa  265  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  55.97 
 
 
241 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.1 
 
 
245 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.69 
 
 
245 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.5 
 
 
246 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 
246 aa  262  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  55.14 
 
 
241 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.31 
 
 
248 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.28 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
241 aa  258  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  53.91 
 
 
240 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.87 
 
 
245 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 
241 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  56.1 
 
 
247 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  52.89 
 
 
241 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.91 
 
 
240 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.88 
 
 
245 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  54.1 
 
 
242 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  54.32 
 
 
241 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.87 
 
 
245 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  51.85 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 
240 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  52.67 
 
 
241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
242 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 
242 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
248 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>