More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0354 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  62.24 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  60.83 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.58 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  61.67 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  59.34 
 
 
241 aa  298  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  60.83 
 
 
241 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  60 
 
 
241 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  57.68 
 
 
241 aa  294  8e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.65 
 
 
242 aa  293  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  57.74 
 
 
240 aa  291  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  58.92 
 
 
241 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  57.08 
 
 
241 aa  287  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  57.32 
 
 
240 aa  287  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.23 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  56.07 
 
 
240 aa  280  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  56.96 
 
 
242 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.23 
 
 
240 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  55.23 
 
 
240 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.23 
 
 
240 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  55.42 
 
 
241 aa  278  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  56.96 
 
 
242 aa  278  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  56.54 
 
 
242 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  55.6 
 
 
241 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  57.08 
 
 
241 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  56.54 
 
 
242 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  58.58 
 
 
242 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  54.58 
 
 
241 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  55.42 
 
 
241 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  55.42 
 
 
241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  54.81 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  57.56 
 
 
242 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  57.56 
 
 
242 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  55.83 
 
 
241 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  55 
 
 
241 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.19 
 
 
241 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  52.3 
 
 
240 aa  267  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.97 
 
 
240 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  52.3 
 
 
240 aa  265  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  54.01 
 
 
247 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  56.85 
 
 
241 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  54.17 
 
 
242 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.33 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  51.02 
 
 
268 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  48.78 
 
 
246 aa  231  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  47.35 
 
 
246 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.94 
 
 
246 aa  228  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 
248 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 
247 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
264 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
264 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
247 aa  224  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  46.91 
 
 
247 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  49.38 
 
 
246 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 
248 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 
248 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  45.49 
 
 
248 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.22 
 
 
249 aa  222  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  44.9 
 
 
252 aa  222  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  48.97 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.15 
 
 
248 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  47.33 
 
 
247 aa  221  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  46.72 
 
 
248 aa  221  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
246 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  46.31 
 
 
248 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  45.9 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  45.9 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  45.9 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  45.9 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  45.9 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  46.69 
 
 
248 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  46.69 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  47.11 
 
 
246 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 
247 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
249 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.61 
 
 
246 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
248 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  47.95 
 
 
247 aa  214  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2322  hypothetical protein  46.72 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.03 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  45.68 
 
 
248 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  45.27 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  45.04 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2305  hypothetical protein  47.73 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.21 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  46.28 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  47.64 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1056  hypothetical protein  46.31 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>