More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1946 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 
242 aa  487  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  66.25 
 
 
241 aa  334  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  65.15 
 
 
241 aa  330  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 
241 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  66.25 
 
 
241 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  65.42 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  64.32 
 
 
241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  65.15 
 
 
241 aa  324  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  66.81 
 
 
242 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  65.15 
 
 
241 aa  321  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  66.24 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  66.24 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  64.41 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  64.41 
 
 
242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  63.98 
 
 
242 aa  318  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  63.98 
 
 
242 aa  317  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  62.92 
 
 
241 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  64.71 
 
 
241 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  63.6 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  63.6 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  64.17 
 
 
241 aa  311  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  62.76 
 
 
240 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  62.08 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  60.58 
 
 
241 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  60.83 
 
 
241 aa  297  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  60 
 
 
241 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  59.58 
 
 
241 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  59.58 
 
 
241 aa  294  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.58 
 
 
240 aa  291  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  63.07 
 
 
241 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.05 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  55.65 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.49 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.92 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.07 
 
 
240 aa  280  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.49 
 
 
240 aa  278  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  55.23 
 
 
240 aa  276  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  54.81 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.17 
 
 
240 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  56.9 
 
 
240 aa  268  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  53.14 
 
 
240 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  59.09 
 
 
246 aa  250  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  57.61 
 
 
246 aa  244  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.24 
 
 
246 aa  241  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  51.69 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  53.75 
 
 
248 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  53.72 
 
 
264 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  53.72 
 
 
264 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  54.17 
 
 
249 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  54.36 
 
 
248 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  50.41 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  51.65 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  52.48 
 
 
248 aa  232  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.96 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  54.08 
 
 
236 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  47.76 
 
 
252 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  48.76 
 
 
248 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.65 
 
 
236 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  51.24 
 
 
247 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.81 
 
 
245 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  54.13 
 
 
249 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  51.24 
 
 
247 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  48.13 
 
 
246 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  52.08 
 
 
248 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.5 
 
 
244 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000690955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2808  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.08 
 
 
244 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000227771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  53.31 
 
 
248 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.2 
 
 
245 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.83 
 
 
277 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  51.65 
 
 
247 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
248 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 
248 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
248 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 
248 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 
248 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.59 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  48.78 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.48 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  48.57 
 
 
248 aa  218  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.61 
 
 
244 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000600536  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  50.83 
 
 
248 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.47 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.17 
 
 
247 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  45.64 
 
 
246 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.38 
 
 
248 aa  215  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  45.64 
 
 
246 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.3 
 
 
245 aa  214  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  51.64 
 
 
247 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  46.06 
 
 
248 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  46.06 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  46.91 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.06 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1215  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.61 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>