More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3677 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.57 
 
 
233 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.55 
 
 
233 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.69 
 
 
233 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.79 
 
 
234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
251 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.78 
 
 
247 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.38 
 
 
247 aa  241  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
268 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
247 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
256 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
249 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.76 
 
 
282 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
247 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
247 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
252 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 
260 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
254 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
234 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.283479  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
254 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  46.15 
 
 
252 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
224 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
254 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.57 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
251 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
245 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
253 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  41.22 
 
 
247 aa  165  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.32 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.8 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.32 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.43 
 
 
247 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
256 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
245 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
251 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.84 
 
 
245 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
253 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329406  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
226 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.69 
 
 
246 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
245 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  41.49 
 
 
241 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
245 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
245 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.08 
 
 
247 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.436635  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
260 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.68 
 
 
249 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
516 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
260 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  38.06 
 
 
248 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
240 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  40.59 
 
 
241 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
246 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
244 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1185  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  41.74 
 
 
255 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.938573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
254 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  39 
 
 
240 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
248 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.83 
 
 
254 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3658  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.69 
 
 
252 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2501  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.83 
 
 
254 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2493  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.83 
 
 
254 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
251 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  40.33 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11512  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase fabG1  40.26 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.298688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
285 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86149  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  41.46 
 
 
255 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
245 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3963  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
251 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.51 
 
 
240 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  38.43 
 
 
240 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.03 
 
 
246 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 
260 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
240 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  37.25 
 
 
248 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6276  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
249 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.63 
 
 
253 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.821391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
250 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  37.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0872  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
247 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>