More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4317 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
234 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.08 
 
 
233 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.94 
 
 
233 aa  343  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.79 
 
 
233 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.79 
 
 
233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.79 
 
 
233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
251 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.47 
 
 
257 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 
268 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
247 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 
249 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
248 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
282 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
252 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
247 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
247 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
248 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
234 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.283479  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
260 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
254 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
246 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  44.18 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
254 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
188 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.51 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.15 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
256 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
254 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
251 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.68 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1415  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.39 
 
 
248 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.949681  normal  0.622645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
247 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
247 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
285 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86149  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.21 
 
 
244 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
224 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
254 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1007  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.08 
 
 
247 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0235176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
270 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.38 
 
 
246 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  38.06 
 
 
247 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
257 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136415  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  41.25 
 
 
241 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
248 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
253 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329406  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
257 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
236 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
247 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474555  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  39.42 
 
 
240 aa  154  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
256 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  40.83 
 
 
242 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
240 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6276  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
249 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.89 
 
 
249 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
245 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  40.83 
 
 
242 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
251 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
241 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
253 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.17 
 
 
240 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
245 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  40 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.68 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 
516 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  0.695361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.68 
 
 
245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  36.51 
 
 
240 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
246 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  42.15 
 
 
247 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.34 
 
 
240 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
246 aa  151  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
246 aa  151  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
253 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386082  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.02 
 
 
244 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
247 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  39.58 
 
 
241 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
245 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
255 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
245 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
246 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
245 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  39.83 
 
 
240 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.3 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>