More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4707 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.283479  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.66 
 
 
268 aa  297  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
249 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 
248 aa  271  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.55 
 
 
256 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
247 aa  268  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.03 
 
 
282 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
247 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
247 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.22 
 
 
260 aa  241  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11168  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.17 
 
 
188 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 
257 aa  214  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
233 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
247 aa  194  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
233 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
233 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
233 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
234 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
247 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  40.79 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
255 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
255 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
248 aa  168  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
248 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1185  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  42.54 
 
 
255 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.938573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
255 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.34 
 
 
246 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
255 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000297813  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
241 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 
255 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
260 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1120  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.93 
 
 
249 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
260 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
256 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
247 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
250 aa  151  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.36 
 
 
246 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
259 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
253 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 
260 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.78 
 
 
247 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
262 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
251 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
267 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
259 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
251 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.47 
 
 
245 aa  143  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
260 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
250 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
251 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
249 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
258 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.19 
 
 
247 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
245 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
264 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.06 
 
 
249 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
264 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.61 
 
 
253 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
245 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
258 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.75 
 
 
247 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
251 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.549634  normal  0.5275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
259 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
252 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1897  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.9 
 
 
245 aa  141  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114593 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
253 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.16 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.5 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  36.32 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.795083  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
261 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  34.91 
 
 
251 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.77 
 
 
244 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>