More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3954 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3954  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0540156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.97 
 
 
257 aa  481  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.78 
 
 
257 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.95 
 
 
257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.9 
 
 
253 aa  251  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
255 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00570  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  44.79 
 
 
267 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000200385  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
249 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
249 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
249 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
249 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28720  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.64 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.382061  normal  0.0594101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
249 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
249 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
253 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
254 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  44.27 
 
 
249 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
254 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
249 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.77933  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
249 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
248 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
249 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
249 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
249 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
249 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
249 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
249 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
256 aa  161  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  37.65 
 
 
248 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
252 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  36.9 
 
 
252 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
247 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
247 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  38.43 
 
 
247 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.77 
 
 
240 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
251 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
233 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
233 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
282 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4157  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0966506  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
245 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  40.56 
 
 
242 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 
246 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1665  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
247 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  38.22 
 
 
240 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
233 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1914  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
246 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.225982  unclonable  0.00000025173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
233 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.6 
 
 
247 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1490  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
246 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179868  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1525  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
246 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.401627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3800  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
252 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
262 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1629  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.25 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722378  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
251 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.35 
 
 
241 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
253 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
249 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.43 
 
 
240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  39.06 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0167  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
241 aa  145  8.000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000024572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.75 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14920  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
247 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  37.74 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  39.22 
 
 
241 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  36.05 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
246 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.04 
 
 
240 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
247 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  37.74 
 
 
248 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  36.48 
 
 
246 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.29 
 
 
248 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  37.35 
 
 
248 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
248 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.55 
 
 
247 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
262 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  35.32 
 
 
248 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  37.5 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
241 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  35.88 
 
 
246 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>