More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0841 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
255 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.52 
 
 
255 aa  289  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.4 
 
 
253 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
257 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00570  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  48.28 
 
 
267 aa  242  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000200385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28720  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  50.2 
 
 
259 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.382061  normal  0.0594101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3954  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
258 aa  237  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0540156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
257 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
249 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
249 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
249 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
249 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
249 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.77933  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
249 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  39.52 
 
 
249 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
282 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
249 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
249 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
249 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
256 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00764889  hitchhiker  0.0046637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  168  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
251 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  41.2 
 
 
252 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
245 aa  163  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
245 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
251 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00853251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
268 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
246 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
247 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
252 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1665  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
247 aa  158  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  39.18 
 
 
241 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
251 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
246 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
260 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
245 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
248 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
251 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
247 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
247 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1629  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.89 
 
 
247 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722378  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
241 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2132  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
244 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000343702  normal  0.0291609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2778  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.14 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 
246 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
247 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
262 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5877  short chain fatty acid oxidoreductase  39.53 
 
 
249 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
282 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
249 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  40.08 
 
 
242 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
247 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 
246 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
249 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
251 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
246 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  40.08 
 
 
242 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
251 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.203044  normal  0.111569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
257 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
246 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  36.11 
 
 
248 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
246 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
246 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
244 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
248 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11512  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase fabG1  39.02 
 
 
247 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.298688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
248 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.04 
 
 
253 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.821391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1120  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
249 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.51 
 
 
234 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
257 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0872  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
247 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0457  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.14 
 
 
242 aa  148  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
255 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
262 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
253 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>