80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3145 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  99.03 
 
 		 413 aa  820    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 413 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  46.62 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 715 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  43.52 
 
 		 688 aa  318  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  43.52 
 
 		 688 aa  318  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  43.46 
 
 		 682 aa  312  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 657 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 		 657 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 705 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 705 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  36.06 
 
 		 705 aa  269  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 705 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  36.34 
 
 		 705 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  40.18 
 
 		 664 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 653 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 705 aa  257  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 		 706 aa  257  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 		 571 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 		 705 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  37.22 
 
 		 701 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 689 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 694 aa  225  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 680 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 701 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  36.77 
 
 		 690 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 		 701 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 707 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 691 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  37.41 
 
 		 695 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 700 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 		 698 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 713 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  39.03 
 
 		 652 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  29 
 
 		 706 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 707 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 		 702 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  35.73 
 
 		 698 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 683 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 		 707 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 677 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 677 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 677 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 696 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30.11 
 
 		 703 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 678 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 679 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 		 689 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 		 687 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 		 699 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 698 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  30.79 
 
 		 700 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.75 
 
 		 677 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 705 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 698 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 		 676 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 700 aa  176  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 		 726 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 684 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 677 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 680 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 691 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 680 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  29.16 
 
 		 729 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 685 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 		 730 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 		 730 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 		 729 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2155  class II aldolase/adducin family protein  32.75 
 
 		 351 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14011  hypothetical protein  26.49 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4067  class II aldolase/adducin family protein  34.92 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2186  hypothetical protein  33.51 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1997  class II aldolase/adducin family protein  27.88 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3319  class II aldolase/adducin family protein  31.87 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2575  hypothetical protein  34.52 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2032  class II aldolase/adducin family protein  32.53 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635701  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0696  class II aldolase/adducin family protein  25.64 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3221  hypothetical protein  30.18 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1395  class II aldolase/adducin-like  29.29 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2749  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>