More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2033 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
270 aa  553  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  58.36 
 
 
269 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 
268 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.76 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6708  glucose 1-dehydrogenase  52.26 
 
 
277 aa  274  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0307985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  50.38 
 
 
261 aa  268  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  50.38 
 
 
261 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  50 
 
 
261 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  47.69 
 
 
261 aa  254  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  47.69 
 
 
261 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  42.75 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
269 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  42.86 
 
 
266 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  44.87 
 
 
261 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
261 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
287 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
271 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  40.07 
 
 
268 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
272 aa  204  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
255 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  45.25 
 
 
261 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 
261 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.86 
 
 
248 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
259 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
269 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.53 
 
 
247 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
259 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
256 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  0.247355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
256 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
269 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.53 
 
 
246 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.92 
 
 
248 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2492  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  42.07 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
258 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 
246 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.14 
 
 
248 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2297  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
266 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844738  decreased coverage  0.0000370278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
249 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.87 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.78 
 
 
246 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1840  glucose 1-dehydrogenase  40.61 
 
 
266 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
249 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
255 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.7 
 
 
252 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0834  acetoin dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
249 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.31 
 
 
250 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 
247 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  39.54 
 
 
255 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2427  acetoin dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3264  acetoin dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0298905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.02 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  40.31 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02067  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.58 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02025  hypothetical protein  38.58 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  34.51 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1510  acetoin dehydrogenase  38.58 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2272  acetoin dehydrogenase  38.58 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  34.51 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.06 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 
246 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
252 aa  172  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
248 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.3 
 
 
246 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.69 
 
 
246 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2737  acetoin dehydrogenase  37.25 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.37 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.3 
 
 
246 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>