More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2692 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.95 
 
 
246 aa  354  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.33 
 
 
246 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  69.39 
 
 
247 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.07 
 
 
247 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.14 
 
 
246 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.36 
 
 
246 aa  339  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  66.53 
 
 
247 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  64.63 
 
 
246 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.61 
 
 
254 aa  320  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.79 
 
 
260 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.68 
 
 
245 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.09 
 
 
245 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.42 
 
 
247 aa  297  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.98 
 
 
245 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.76 
 
 
246 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.17 
 
 
247 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.75 
 
 
244 aa  292  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  59.75 
 
 
247 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 
245 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.16 
 
 
245 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
247 aa  287  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
245 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.68 
 
 
245 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.68 
 
 
245 aa  284  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.97 
 
 
269 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.79 
 
 
247 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.79 
 
 
247 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.79 
 
 
247 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  57.79 
 
 
247 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.79 
 
 
247 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.79 
 
 
247 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  57.79 
 
 
247 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
254 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
245 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.25 
 
 
246 aa  261  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.17 
 
 
248 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
261 aa  254  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  54.13 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  54.81 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
245 aa  252  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
246 aa  248  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 
245 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
253 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.44 
 
 
245 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
244 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
250 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.146293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
246 aa  234  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.87 
 
 
247 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963194  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.28 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
246 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  41.56 
 
 
247 aa  193  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
242 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
247 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
248 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
243 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
250 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  46.5 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.44 
 
 
247 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
262 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
243 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  41.87 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
251 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
254 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
254 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
248 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
248 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 
246 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 
246 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
246 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.39 
 
 
246 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
248 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.49 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.94 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.98 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  41.49 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.68 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
249 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
248 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.32 
 
 
247 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
249 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
249 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
246 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.03 
 
 
247 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
249 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
248 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.12 
 
 
247 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>