More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1994 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  497  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.67 
 
 
248 aa  333  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.51 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.47 
 
 
250 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.146293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
254 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  55.33 
 
 
247 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.17 
 
 
246 aa  275  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.02 
 
 
245 aa  274  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.3 
 
 
245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
245 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  56.85 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  56.61 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.25 
 
 
246 aa  271  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.44 
 
 
244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.17 
 
 
246 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.17 
 
 
245 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.64 
 
 
260 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  55 
 
 
246 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.83 
 
 
245 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.41 
 
 
245 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
253 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  56.07 
 
 
245 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.5 
 
 
246 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
245 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
245 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.17 
 
 
247 aa  258  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
254 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
244 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.87 
 
 
247 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963194  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
247 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
246 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.68 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.38 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.39 
 
 
245 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.7 
 
 
269 aa  242  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  56.38 
 
 
245 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  55.14 
 
 
245 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  54.39 
 
 
247 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.26 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.26 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
245 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  52.26 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.26 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.26 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.26 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  52.26 
 
 
247 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
246 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 
246 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
246 aa  198  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
242 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
247 aa  192  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  41.67 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
247 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  40.42 
 
 
243 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  39.84 
 
 
247 aa  168  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  42.45 
 
 
248 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  40.41 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.98 
 
 
246 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.63 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  41.63 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  38.75 
 
 
243 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.39 
 
 
247 aa  161  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
286 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
254 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
249 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.39 
 
 
247 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 
248 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
243 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
257 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  38 
 
 
254 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
236 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
249 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
249 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
248 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
242 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.66 
 
 
247 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
248 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
254 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
261 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
254 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.75 
 
 
249 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
254 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  35.88 
 
 
265 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
254 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.26 
 
 
249 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
271 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
254 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
243 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
251 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2412  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.19 
 
 
258 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.75 
 
 
250 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.75 
 
 
250 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>