More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1306 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.146293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.02 
 
 
261 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.47 
 
 
254 aa  311  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65 
 
 
248 aa  304  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
245 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 
247 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963194  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 
247 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 
245 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 
246 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.51 
 
 
246 aa  261  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.74 
 
 
245 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  55.83 
 
 
247 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 
247 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.92 
 
 
244 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.26 
 
 
245 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.67 
 
 
246 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.33 
 
 
247 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
245 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
245 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
246 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  53.94 
 
 
246 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.43 
 
 
246 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
254 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
247 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
245 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
244 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.67 
 
 
246 aa  235  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.56 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  52.72 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.18 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.07 
 
 
269 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  51.88 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.58 
 
 
253 aa  225  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
245 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
245 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.3 
 
 
247 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  52.3 
 
 
247 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.3 
 
 
247 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.3 
 
 
247 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.3 
 
 
247 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  52.3 
 
 
247 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  51.88 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  51.88 
 
 
245 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  50.63 
 
 
245 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
246 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
247 aa  185  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
242 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
246 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
246 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  41.91 
 
 
243 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
247 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  38.7 
 
 
264 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
242 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
243 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  41.83 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
254 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
254 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
262 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
249 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
247 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  39.18 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2412  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.33 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
247 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  34.8 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
248 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2004  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
248 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.108608  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06849  hypothetical protein  37.08 
 
 
243 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
249 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.37 
 
 
247 aa  142  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
248 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.14 
 
 
246 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
248 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
248 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
286 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
248 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
248 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
248 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  40.24 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  38.37 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
251 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
246 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
248 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
248 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.63 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.17 
 
 
246 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
249 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>