More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0880 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
252 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
252 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
252 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
252 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
252 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
252 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.94 
 
 
254 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
255 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  46.4 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
254 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
245 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
255 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
254 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
255 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
260 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 
257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
246 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
254 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
245 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
254 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
254 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
247 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
247 aa  175  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
263 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
254 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
245 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
254 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
252 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 
246 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  40 
 
 
247 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
256 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  40 
 
 
250 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
246 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
254 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
254 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  41.83 
 
 
247 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
262 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
245 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
247 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  42.23 
 
 
254 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
246 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.96 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  43.08 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
252 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
247 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
251 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
253 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
255 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
247 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
253 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
252 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.82 
 
 
250 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
254 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
254 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
244 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
246 aa  158  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
250 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
249 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.78 
 
 
250 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.3 
 
 
250 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
246 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
251 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
253 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.89 
 
 
251 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.19 
 
 
246 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
247 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
242 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 
246 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
249 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
246 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>