More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5176 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  100 
 
 
254 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.09 
 
 
254 aa  431  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.01 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  49.4 
 
 
252 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.85 
 
 
254 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  49 
 
 
252 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  49 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  49 
 
 
252 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
252 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
252 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
252 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
252 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
252 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  44.88 
 
 
254 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
254 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
257 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
257 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
254 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
254 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
255 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
253 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
253 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
254 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  48.58 
 
 
248 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  45.53 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
257 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
263 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
248 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
253 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
246 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
257 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
255 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
249 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
253 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
243 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
252 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
248 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
251 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
248 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
248 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
248 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
250 aa  165  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
246 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  40.08 
 
 
264 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
248 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
249 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
249 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
251 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
254 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
248 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40.96 
 
 
246 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
243 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
248 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
254 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
253 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
248 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
248 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38.02 
 
 
266 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
253 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
255 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
253 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
248 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  38.1 
 
 
247 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
256 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
263 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
246 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
260 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>