More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4321 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.43 
 
 		 252 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.64 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.47 
 
 		 259 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.94 
 
 		 250 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.9 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.06 
 
 		 255 aa  321  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.73 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.89 
 
 		 252 aa  318  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.73 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.73 
 
 		 253 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.35 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 253 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.95 
 
 		 269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.26 
 
 		 254 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  67.21 
 
 		 256 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  61.51 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.2 
 
 		 263 aa  301  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.96 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 		 252 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.68 
 
 		 194 aa  284  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.86 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  57.14 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.16 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  54.84 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.54 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.98 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 		 250 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 		 247 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.22 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  41.53 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  39.68 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.31 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>