More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05466 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.38 
 
 
254 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.38 
 
 
254 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
251 aa  208  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
251 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  46.75 
 
 
248 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.58 
 
 
249 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.72 
 
 
246 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.77 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
247 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
247 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.18 
 
 
249 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
249 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
260 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.8 
 
 
247 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.54 
 
 
247 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
262 aa  191  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
246 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
249 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.72 
 
 
250 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
246 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.57 
 
 
248 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
248 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.06 
 
 
246 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
249 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  46.5 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.98 
 
 
247 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
254 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.06 
 
 
246 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40.33 
 
 
246 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
246 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
246 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
246 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
246 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
246 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.57 
 
 
248 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
246 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
249 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.21 
 
 
247 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
250 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.09 
 
 
249 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.85 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.44 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.62 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  45.04 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  45.31 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.44 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.44 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
246 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
248 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
251 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
246 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
248 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
247 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
244 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
247 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5033  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.08 
 
 
244 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
249 aa  178  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.5 
 
 
246 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 
254 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
247 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
247 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
249 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.5 
 
 
246 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
248 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
257 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.44 
 
 
247 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.67 
 
 
247 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
254 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.85 
 
 
250 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
247 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.76 
 
 
246 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
248 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
248 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
249 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.98 
 
 
246 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
255 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
247 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.04 
 
 
269 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
255 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
248 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.98 
 
 
249 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>