More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1337 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  487  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.74 
 
 
248 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.15 
 
 
248 aa  453  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.58 
 
 
248 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.15 
 
 
248 aa  453  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.15 
 
 
248 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.64 
 
 
274 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.02 
 
 
248 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.82 
 
 
248 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.02 
 
 
248 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.76 
 
 
248 aa  362  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.46 
 
 
248 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.46 
 
 
248 aa  357  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.18 
 
 
262 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75 
 
 
248 aa  352  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.76 
 
 
248 aa  348  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.58 
 
 
248 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  68.15 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 
250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.05 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
249 aa  288  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.16 
 
 
271 aa  287  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
249 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
249 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 
249 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
255 aa  271  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  52.82 
 
 
246 aa  263  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
249 aa  248  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
250 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
251 aa  234  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4242  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  56.1 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 
249 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.05 
 
 
250 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  45.53 
 
 
255 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
254 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
254 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
261 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.9 
 
 
247 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.53 
 
 
247 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.62 
 
 
269 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
247 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
285 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
245 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 
246 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
246 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  43.37 
 
 
247 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
284 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.11 
 
 
247 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
243 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  43.67 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
247 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
249 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
285 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
260 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  43.67 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
285 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.5 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
243 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
252 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
254 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
253 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.46 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
285 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
292 aa  171  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
285 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
284 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
247 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 
247 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
257 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
250 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
246 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
247 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
246 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>