More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1370 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.47 
 
 
249 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 
250 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.37 
 
 
248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.37 
 
 
248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.97 
 
 
248 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.45 
 
 
248 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.06 
 
 
248 aa  308  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.05 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.86 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.86 
 
 
248 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.11 
 
 
251 aa  298  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 
255 aa  294  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.16 
 
 
248 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 
248 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.65 
 
 
248 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
249 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.35 
 
 
248 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.86 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 
248 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 
274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.85 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.48 
 
 
249 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  59.44 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
251 aa  270  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  56.28 
 
 
246 aa  267  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 
249 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 
248 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.44 
 
 
248 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 
251 aa  249  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
249 aa  232  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
250 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
250 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4242  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  55.06 
 
 
250 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
261 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
250 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
246 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
246 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
245 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.31 
 
 
269 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  45.97 
 
 
247 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
245 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  43.27 
 
 
255 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
245 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
245 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.49 
 
 
247 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
246 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
254 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
254 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
254 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
246 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
246 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  44.13 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
247 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  39.76 
 
 
264 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
245 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  42.91 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
246 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
246 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  40.55 
 
 
265 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
242 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
247 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
246 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
254 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
246 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  42.47 
 
 
261 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  44.81 
 
 
245 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.27 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.39 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.39 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  43.27 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.27 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.27 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.27 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.27 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.78 
 
 
246 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
251 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
251 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
251 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
245 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.32 
 
 
244 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
249 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
252 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  41.41 
 
 
252 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
254 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
245 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
254 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
252 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>