More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2348 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  71.65 
 
 
254 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62 
 
 
256 aa  323  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.42 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.73 
 
 
256 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
250 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 
250 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 
251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
255 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.54 
 
 
259 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.37 
 
 
252 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
259 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
253 aa  291  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
254 aa  291  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 
256 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.22 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
252 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
253 aa  280  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
254 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
254 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
251 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 
251 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
253 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
253 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
253 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
254 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
253 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 
251 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
251 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.95 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  52.19 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  54.15 
 
 
256 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
253 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
256 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
252 aa  249  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
263 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49 
 
 
252 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
275 aa  245  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
247 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.44 
 
 
194 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.44 
 
 
247 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
277 aa  201  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
254 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
255 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
250 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.63 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
248 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
248 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
247 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
255 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
262 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 
254 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
253 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
257 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
257 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
254 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  41.77 
 
 
248 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
246 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
248 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
248 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
249 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
247 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40.39 
 
 
246 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
255 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
246 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
248 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
254 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
254 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
246 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
248 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
249 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  35.8 
 
 
255 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>