More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0911 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.59 
 
 		 254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.29 
 
 		 269 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.29 
 
 		 269 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.73 
 
 		 251 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.54 
 
 		 256 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.48 
 
 		 251 aa  327  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  68.38 
 
 		 256 aa  325  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.75 
 
 		 253 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.4 
 
 		 259 aa  321  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.14 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.57 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.69 
 
 		 255 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.57 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.65 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.26 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 		 256 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  58.17 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.46 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.26 
 
 		 194 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.71 
 
 		 253 aa  271  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  52.99 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  54.03 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 		 275 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  49.19 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.41 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  42.21 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>