More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0248 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.21 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.05 
 
 		 253 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.75 
 
 		 253 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.96 
 
 		 253 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.96 
 
 		 253 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 252 aa  334  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.2 
 
 		 250 aa  333  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.49 
 
 		 255 aa  331  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.35 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.6 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.52 
 
 		 252 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.3 
 
 		 259 aa  324  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 		 254 aa  317  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.08 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  64.8 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 269 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.35 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 		 256 aa  301  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 		 251 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  57.72 
 
 		 254 aa  294  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.4 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.48 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.54 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 		 254 aa  287  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.62 
 
 		 194 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  51.79 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  51.39 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  48.78 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.15 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  37.05 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.25 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>