More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3747 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 
254 aa  317  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 
256 aa  297  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
252 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
254 aa  291  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
250 aa  288  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  55.38 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
254 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
253 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.87 
 
 
253 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.88 
 
 
252 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
256 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
253 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
253 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
251 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
255 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
253 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 
253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.4 
 
 
251 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
269 aa  271  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.88 
 
 
259 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
255 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 
254 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
259 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
251 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
256 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
254 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
253 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
250 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
252 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  52 
 
 
252 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  53.41 
 
 
256 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
250 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
252 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
253 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  48.59 
 
 
252 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  45.93 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
275 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.04 
 
 
251 aa  232  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
256 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
194 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
277 aa  200  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
262 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.65 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
254 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
255 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
253 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
263 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
257 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
254 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
252 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
250 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
252 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
252 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
252 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
255 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
247 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  36.95 
 
 
248 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
257 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.15 
 
 
246 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
248 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
247 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
260 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
248 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
247 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
262 aa  148  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  36.99 
 
 
248 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
247 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
246 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>