More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2023 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
275 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.6 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
252 aa  280  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.57 
 
 
255 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 
259 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.52 
 
 
255 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
251 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  51.39 
 
 
252 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
256 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.77 
 
 
263 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.29 
 
 
256 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
254 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.86 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 
252 aa  261  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 
251 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 
251 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  48.4 
 
 
254 aa  258  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  50.6 
 
 
252 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 
253 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
256 aa  255  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
254 aa  255  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
254 aa  250  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
253 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
253 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
253 aa  248  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 
253 aa  248  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
253 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
269 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
269 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
250 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  50.91 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
256 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
247 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
252 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
250 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.72 
 
 
247 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
248 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
248 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
248 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
277 aa  198  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
262 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
253 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
254 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.4 
 
 
254 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
255 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
254 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
254 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
254 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
257 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
257 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
257 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
257 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
252 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  40.64 
 
 
248 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
247 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
252 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
252 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
252 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
252 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
252 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
252 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
252 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
252 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
263 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
257 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
246 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
261 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
251 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
248 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
254 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
249 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
252 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
260 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
262 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
248 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>