More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5828 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  44.76 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  46.51 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  41.37 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.55 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 250 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.58 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 249 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  38.21 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 		 265 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>