More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5170 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.77 
 
 
257 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.43 
 
 
254 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  48.81 
 
 
257 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  49.21 
 
 
254 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  48.81 
 
 
257 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
252 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  48.41 
 
 
254 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
252 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  48.81 
 
 
254 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
252 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
252 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
252 aa  235  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
252 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  48.41 
 
 
257 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  48.41 
 
 
257 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
252 aa  234  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  48.41 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
252 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 
254 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
254 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
252 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
254 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
254 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
254 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
256 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
255 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
254 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
259 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
263 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
247 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
250 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
251 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
255 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41.96 
 
 
255 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
252 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  44 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
252 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
262 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
252 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
252 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  40.32 
 
 
248 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  37.7 
 
 
254 aa  159  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
254 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
246 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
246 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
246 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
254 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
262 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
253 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
256 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
253 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
247 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
256 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
249 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
254 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
269 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
269 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
251 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
254 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
259 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
251 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
259 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  39.53 
 
 
247 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
248 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
246 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
253 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
245 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
246 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
248 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
254 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
255 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  38.49 
 
 
256 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  38.43 
 
 
248 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>