More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2597 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  100 
 
 		 252 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  87.7 
 
 		 252 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.94 
 
 		 252 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.51 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.96 
 
 		 255 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 		 250 aa  296  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 		 269 aa  277  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 		 269 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  53.82 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 256 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 		 259 aa  261  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 		 275 aa  258  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 		 253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  54.8 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 		 254 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.9 
 
 		 194 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.72 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.15 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  39.53 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>