More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0177 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.77 
 
 		 269 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.21 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.29 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.97 
 
 		 259 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.58 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.76 
 
 		 255 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.76 
 
 		 252 aa  348  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.74 
 
 		 255 aa  344  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  73.79 
 
 		 256 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.35 
 
 		 251 aa  343  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.46 
 
 		 253 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.74 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.27 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.39 
 
 		 251 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.94 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.85 
 
 		 256 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.73 
 
 		 253 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 		 253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.92 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.8 
 
 		 251 aa  318  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.01 
 
 		 256 aa  318  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  61.45 
 
 		 254 aa  314  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.36 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.35 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  59.27 
 
 		 252 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 		 251 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.38 
 
 		 194 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.52 
 
 		 252 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 		 254 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  58.06 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 		 254 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 		 250 aa  285  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 		 254 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  51.22 
 
 		 247 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 		 250 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.78 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  40.16 
 
 		 248 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.22 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.73 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1961  putative glucose 1-dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.536357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2039  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.8 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380824  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>