More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.92 
 
 		 247 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.66 
 
 		 247 aa  377  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.2 
 
 		 250 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 		 259 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  51.22 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  44.72 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  44.72 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.9 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 		 194 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 		 275 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.78 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 254 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  35.37 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>