More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3113 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  493  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 
254 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
250 aa  267  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 
251 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
254 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
252 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
255 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
256 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
255 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
253 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.75 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
253 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
254 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
253 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
251 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
269 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
253 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
269 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
252 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  47.2 
 
 
254 aa  241  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
259 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  54.94 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
253 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
252 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
253 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  49.19 
 
 
252 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
254 aa  221  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
254 aa  218  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
275 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
252 aa  214  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.77 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
253 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
247 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
262 aa  198  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
247 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  43.44 
 
 
247 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
277 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
249 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
246 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
247 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
254 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
253 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
246 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
251 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
254 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
253 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
261 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.38 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  41.37 
 
 
255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
246 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
257 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 
254 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
246 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  40.64 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
246 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 
246 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
246 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
246 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  39.13 
 
 
255 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
254 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.58 
 
 
247 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
257 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
260 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 
269 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
254 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
254 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
247 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
252 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.16 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  42 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>