More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0121 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521218  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.2 
 
 
246 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.69 
 
 
246 aa  324  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.29 
 
 
246 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.69 
 
 
246 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.8 
 
 
246 aa  318  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.47 
 
 
246 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.2 
 
 
245 aa  284  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
247 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.59 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.59 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.59 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.59 
 
 
246 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
246 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.41 
 
 
246 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
261 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
247 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.18 
 
 
246 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.2 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.43 
 
 
249 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.02 
 
 
249 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.02 
 
 
249 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  51.85 
 
 
249 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
251 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
251 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
251 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
248 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.65 
 
 
248 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.85 
 
 
249 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
248 aa  228  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2813  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.77 
 
 
254 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5033  short chain dehydrogenase  51.87 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  52.3 
 
 
243 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
246 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202973  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
248 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.04 
 
 
249 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.54 
 
 
249 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.54 
 
 
249 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  51.91 
 
 
243 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.13 
 
 
249 aa  215  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.13 
 
 
249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.87 
 
 
248 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.87 
 
 
248 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.87 
 
 
248 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424016  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 
247 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
248 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881664  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02300  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.89 
 
 
250 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
247 aa  204  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
248 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
249 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
255 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0262  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.26 
 
 
250 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.520001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.26 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37322  normal  0.510566 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
248 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
246 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  46.09 
 
 
247 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332665  normal  0.273672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
247 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
250 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3874  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 
256 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122974  normal  0.933314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
246 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
255 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
248 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.397771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
253 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
254 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.93 
 
 
246 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
254 aa  178  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
254 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
254 aa  178  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
257 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
257 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
257 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.71 
 
 
247 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  45.9 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.5 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  43.85 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.59 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1798  oxidoreductase  43.44 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0401257  normal  0.0380539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0085  oxidoreductase  43.85 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.689145  normal  0.340405 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
237 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  43.44 
 
 
237 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4821  oxidoreductase  40.98 
 
 
237 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3763  oxidoreductase  40.98 
 
 
237 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.68 
 
 
246 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1800  oxidoreductase  43.44 
 
 
237 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.419385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04116  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40.57 
 
 
237 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1657  oxidoreductase  43.44 
 
 
237 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>