More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1897 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.64 
 
 
248 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.1 
 
 
248 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.1 
 
 
248 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.64 
 
 
248 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.64 
 
 
248 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  87.04 
 
 
248 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.18 
 
 
248 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.98 
 
 
248 aa  359  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.47 
 
 
262 aa  359  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.6 
 
 
248 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.97 
 
 
248 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.98 
 
 
248 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.18 
 
 
248 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.6 
 
 
248 aa  341  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.79 
 
 
248 aa  341  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.18 
 
 
248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  66.94 
 
 
248 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.25 
 
 
249 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
250 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
249 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 
249 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 
271 aa  284  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
249 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 
249 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 
249 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
251 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
255 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  51.21 
 
 
246 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.02 
 
 
251 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.54 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
251 aa  235  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4242  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  55.47 
 
 
250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
249 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 
250 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 
249 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
246 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
246 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
247 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  43.5 
 
 
255 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
246 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.07 
 
 
269 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
261 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
247 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.09 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
246 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
245 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
246 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
260 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  45.16 
 
 
247 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
254 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 
246 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.73 
 
 
250 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.73 
 
 
250 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
257 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
284 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 
254 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.23 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.9 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  43.9 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.2 
 
 
250 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.9 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.9 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.9 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.9 
 
 
247 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  43.9 
 
 
247 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
246 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
248 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
246 aa  168  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
248 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
248 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
248 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
245 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
257 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 
244 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
248 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.56 
 
 
247 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
284 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
245 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
285 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.32 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>