More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2480 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  40.73 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  37.6 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  40.32 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  43.62 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 		 246 aa  185  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  37.55 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 246 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  40.33 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.58 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 245 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 		 257 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 		 257 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  39.58 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.58 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.58 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.58 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  39.58 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.58 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.58 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 245 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  35.23 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 245 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 252 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 252 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  35.37 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>