More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4158 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  64.02 
 
 		 264 aa  322  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  62.36 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  61.39 
 
 		 259 aa  318  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  59.54 
 
 		 259 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  60.62 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  63.02 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  59.16 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  59 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  63.33 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  63.33 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  63.33 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  56.25 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  54.51 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  54.33 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  54.09 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  52.36 
 
 		 257 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  54.09 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  51.74 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  53.15 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  48.63 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.45 
 
 		 257 aa  234  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  48.05 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  48.41 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  47.88 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  46.69 
 
 		 259 aa  218  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  44.84 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  45 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  47.41 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  47.24 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  43.75 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  46.1 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.46 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  43.97 
 
 		 261 aa  191  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  46.09 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  41.11 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  42.32 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  38.91 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.85 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  38.67 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  37.75 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  38.65 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  37.45 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  37.7 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  36.68 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  36.68 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  37.94 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  38.19 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  37.4 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  37.25 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  36.29 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  38.37 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  37.15 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  37.65 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  37.3 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  37.3 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  38.4 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  38.1 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298629  hitchhiker  0.00223768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  36.95 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5141  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116654  normal  0.551498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.27 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  37.6 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  36.47 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  37.1 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>