More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1449 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  72.83 
 
 
253 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  66.93 
 
 
254 aa  355  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  68.77 
 
 
258 aa  349  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  66.54 
 
 
258 aa  344  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  66.54 
 
 
258 aa  344  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  64.45 
 
 
262 aa  328  7e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  63.14 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  62.99 
 
 
257 aa  325  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  62.16 
 
 
259 aa  322  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  59.92 
 
 
257 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  59.92 
 
 
257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  59.14 
 
 
257 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  48.82 
 
 
259 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  46.06 
 
 
259 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  48.63 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  48.03 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  45.74 
 
 
258 aa  225  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  44.49 
 
 
268 aa  224  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  47.47 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  45.8 
 
 
264 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  45.56 
 
 
264 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.75 
 
 
257 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  43.75 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
253 aa  199  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0363  acetoin reductase  47.83 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  44.09 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  41.31 
 
 
260 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  44.27 
 
 
270 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  44.27 
 
 
285 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  44.27 
 
 
285 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  42.02 
 
 
257 aa  185  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  42.25 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.67 
 
 
246 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
247 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
247 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
254 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  36.95 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.54 
 
 
250 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.54 
 
 
250 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.49 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.27 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881664  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
245 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.87 
 
 
246 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.87 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 
246 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
246 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
265 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
248 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
248 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
260 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  37.25 
 
 
247 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.43 
 
 
255 aa  158  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
248 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.58 
 
 
251 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
262 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
262 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
247 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
261 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 
246 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  36.25 
 
 
260 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
246 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
248 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  38.34 
 
 
264 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.72 
 
 
246 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
245 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.28 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  34.39 
 
 
258 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  34.39 
 
 
258 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
247 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
246 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  34.39 
 
 
258 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
246 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.04 
 
 
250 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
258 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  34.39 
 
 
258 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  35.97 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
284 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
265 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
248 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  34.39 
 
 
258 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>