More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1592 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  100 
 
 
236 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  65.11 
 
 
237 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  62.39 
 
 
237 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  60.09 
 
 
237 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  60 
 
 
270 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  60 
 
 
240 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  59.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  59.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  59.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  59.17 
 
 
240 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  59.58 
 
 
240 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  60.83 
 
 
240 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  65 
 
 
204 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  60.94 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  60.94 
 
 
237 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  60.94 
 
 
237 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
238 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
238 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
234 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 
245 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  39.39 
 
 
222 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
245 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
250 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
238 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
241 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
238 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
237 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  45.09 
 
 
250 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
245 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
237 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 
246 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
248 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
248 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
246 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
245 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
245 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.97 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
245 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
205 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
254 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
249 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
249 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
258 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.54 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
262 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  34.44 
 
 
251 aa  99  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
274 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
262 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.44 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.436635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.41 
 
 
242 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
256 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.6 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
275 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0756  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.27 
 
 
251 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0694  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.28 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0384392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3418  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.94 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786662  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
253 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0637  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.67 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.4 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0651  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  32.16 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>