More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1512 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  66.54 
 
 
259 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2137  short chain dehydrogenase  58.04 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.422468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
261 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
267 aa  248  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
257 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2066  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 
251 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1386  short chain dehydrogenase  51.55 
 
 
256 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13582  short chain dehydrogenase  49.22 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  48.61 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2830  short chain dehydrogenase  48.82 
 
 
247 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2633  short chain dehydrogenase  50.39 
 
 
252 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522404  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3623  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 
280 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4682  short chain dehydrogenase  47.13 
 
 
244 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4768  short chain dehydrogenase  47.13 
 
 
244 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0810301  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  49.01 
 
 
254 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5067  short chain dehydrogenase  47.13 
 
 
244 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325095  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5265  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 
265 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1491  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 
233 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.74 
 
 
261 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
261 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
261 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  37.3 
 
 
261 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0623  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.28 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
249 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0536617  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
260 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.22175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
256 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 
245 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
238 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 
255 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.68 
 
 
255 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
272 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.76 
 
 
255 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
252 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
254 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
295 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 
259 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
252 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
254 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
257 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
257 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
271 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  29.64 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2236  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0079693  hitchhiker  0.0000000000146791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.24 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
290 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
257 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 
261 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 
249 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
241 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
258 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
264 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
268 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
255 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.54 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
304 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  31.87 
 
 
258 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.94 
 
 
255 aa  118  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  34 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319353 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  31.76 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>