More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2918 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.69 
 
 
250 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  69.64 
 
 
250 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.33 
 
 
251 aa  348  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.62 
 
 
247 aa  345  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  70.95 
 
 
258 aa  344  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  64.34 
 
 
250 aa  315  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.6 
 
 
252 aa  310  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.18 
 
 
251 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.8 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.78 
 
 
256 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.78 
 
 
264 aa  241  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
261 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
286 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.85 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
272 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
254 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
258 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
257 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  40.73 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
254 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
255 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
254 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
248 aa  166  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
255 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 
254 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
257 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  43.2 
 
 
255 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
254 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
266 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
266 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
260 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
257 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
254 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
254 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
254 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
257 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
254 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
254 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
255 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
254 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 
256 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
254 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
249 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
247 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
253 aa  152  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
255 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
255 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
254 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
258 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
261 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
246 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
249 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
255 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 
247 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
246 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.87 
 
 
247 aa  148  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
256 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
248 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
253 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
255 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
254 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.4 
 
 
245 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
249 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
254 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
247 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 
255 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
255 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43336  Glucose 1-dehydrogenase peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  33.73 
 
 
253 aa  141  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.04 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.27 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>