More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0623 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0623  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4703  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  65.46 
 
 
269 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0903  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  65.06 
 
 
269 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5482  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  65.46 
 
 
269 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3566  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  65.46 
 
 
269 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102569  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4801  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  65.46 
 
 
269 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.996441  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4181  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  64.66 
 
 
269 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.220701  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.05 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.04 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503149  hitchhiker  0.00343505 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1367  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.84 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2464  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.84 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.893571  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0940  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.84 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0352  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.84 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0631  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.84 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343147  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1197  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  68.18 
 
 
277 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1271  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  68.18 
 
 
277 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346222  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1539  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  66.83 
 
 
276 aa  248  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.03 
 
 
253 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5308  dehydrogenase  44 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
257 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
258 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.22 
 
 
258 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
259 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0536617  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
248 aa  182  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0179  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
259 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0190  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
259 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0199  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
259 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
251 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
262 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1235  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 
259 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183265  normal  0.0279411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
259 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
248 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
262 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.89 
 
 
248 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
257 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
263 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
252 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
258 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
256 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
275 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
260 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
247 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
261 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
263 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
262 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3017  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
263 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0666  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.65 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.948597  decreased coverage  0.000102721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
255 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
246 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
285 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
246 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  34.22 
 
 
270 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
253 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
285 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
246 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
285 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
262 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
285 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.99 
 
 
246 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.39 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
247 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
254 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
269 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
276 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
282 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  41.13 
 
 
261 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251558  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
282 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
285 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
263 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
251 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
263 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
263 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
248 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
263 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
263 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
263 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
263 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.47 
 
 
262 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
264 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
253 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
254 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.44 
 
 
249 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
263 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>