More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1834 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  510  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 
255 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.45 
 
 
255 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.57 
 
 
284 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
284 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
284 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.35 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
260 aa  268  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
269 aa  263  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490392  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  51.94 
 
 
262 aa  262  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.16 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
260 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.12 
 
 
258 aa  251  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
255 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
259 aa  238  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
268 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0330322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
258 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
256 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
256 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
268 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 
260 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02410  conserved hypothetical protein  44.31 
 
 
264 aa  226  4e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.167898  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 
267 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.223679  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
256 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
267 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
268 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  0.73895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
268 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
257 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0751  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  50.97 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  45.31 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10306  predicted protein  43.48 
 
 
267 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
258 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00784  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_1G14540)  43.35 
 
 
281 aa  194  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  43.85 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  42.25 
 
 
264 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  41.27 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.55 
 
 
260 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  41.47 
 
 
262 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  40.54 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61314  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  37.89 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.723211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  40.54 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  40.7 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  40.31 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  40.54 
 
 
258 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  38.08 
 
 
263 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  39.77 
 
 
260 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  41.31 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
257 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  40 
 
 
267 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
257 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
258 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  40.47 
 
 
263 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
257 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  38.76 
 
 
260 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 
263 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 
263 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
252 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16609  predicted protein  41.74 
 
 
266 aa  152  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.02 
 
 
255 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  37.11 
 
 
259 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
259 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  39.69 
 
 
262 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.99 
 
 
249 aa  148  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08403  conserved hypothetical protein  40.15 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706703  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.47 
 
 
253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  39.6 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17766  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
257 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
266 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
245 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
257 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
265 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
257 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
246 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
264 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
245 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
245 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
249 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>