More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4562 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.22 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.59 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.91 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  51.44 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  40.71 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  38.65 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  38.46 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  37.55 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.68 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.4 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>