More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4818 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.36 
 
 
256 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.73 
 
 
256 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.73 
 
 
256 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.56 
 
 
256 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.39 
 
 
256 aa  290  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  40 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
254 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
266 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
256 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
253 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
257 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.84 
 
 
251 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
266 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  38 
 
 
253 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
257 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34.27 
 
 
259 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  35.83 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
254 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.94 
 
 
260 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
284 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
254 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
254 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
284 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
284 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  34.27 
 
 
257 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
252 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
255 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
255 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
255 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
255 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
255 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
254 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
256 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  37.25 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
255 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
254 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
255 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
254 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
260 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  32.28 
 
 
260 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
261 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
253 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
266 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
263 aa  141  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.993819  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
259 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  32.28 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  32.69 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
250 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  32.68 
 
 
260 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
258 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 
249 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
254 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
263 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.393265  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 
254 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0428484  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6035  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
255 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0967664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
254 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.78 
 
 
255 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
253 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.1 
 
 
255 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.63 
 
 
254 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
248 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
260 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
254 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
253 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
253 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
288 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>