More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2139 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  86.85 
 
 		 253 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  80.88 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  79.28 
 
 		 253 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  71.94 
 
 		 255 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  73.49 
 
 		 256 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  71.15 
 
 		 255 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  70.4 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  69.96 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  71.31 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  72.11 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  69.96 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  70.52 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  69.17 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  69.96 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  71.31 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  69.96 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  70.52 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  70.12 
 
 		 254 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  71.31 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  69.64 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  69.57 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  70.52 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  70.92 
 
 		 254 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  70.92 
 
 		 254 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  70.92 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  67.19 
 
 		 255 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  67.98 
 
 		 255 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  70.12 
 
 		 254 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  62.55 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  63.35 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  57.43 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 		 257 aa  264  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  42.63 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.36 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  39.29 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 286 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.08 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  40 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.89 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  38.55 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>