More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3071 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.86 
 
 		 255 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.69 
 
 		 255 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.62 
 
 		 254 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.33 
 
 		 255 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.69 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.47 
 
 		 254 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.5 
 
 		 254 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.33 
 
 		 255 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.84 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.27 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.88 
 
 		 255 aa  347  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.49 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.2 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.6 
 
 		 257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  58 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4321  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19521  normal  0.023029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6035  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0967664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.15 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.4 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.95 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>