More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3978 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.85 
 
 
256 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 
286 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
258 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
261 aa  245  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
254 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.09 
 
 
260 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
251 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
251 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.8 
 
 
251 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
250 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
247 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.7 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.18 
 
 
250 aa  208  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.82 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.32 
 
 
250 aa  198  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
257 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
257 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
258 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
255 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
264 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  47.18 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
257 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  46 
 
 
253 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
254 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
257 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
254 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
255 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
255 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
255 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
254 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
253 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
255 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
266 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
262 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
255 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
266 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 
254 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
248 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  43.9 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  44.73 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
254 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 
254 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 
254 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  44 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
254 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
254 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
254 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
254 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
256 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
255 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
255 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  43.15 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
247 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
256 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
246 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
255 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 
247 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  41.04 
 
 
259 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
255 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 
248 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 
252 aa  158  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
248 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
249 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.89 
 
 
247 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
246 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 
246 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 
255 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 
255 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 
245 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.8 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.76 
 
 
251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.15 
 
 
245 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
247 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
245 aa  152  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>