More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4013 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.86 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.8 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.7 
 
 		 250 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.32 
 
 		 251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.38 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.98 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.02 
 
 		 252 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.44 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.42 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.27 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.7 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.5 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  42.8 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  40.71 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.22 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.89 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  36.78 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.2 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 		 271 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>