More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1630 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  477  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.9 
 
 
256 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.89 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
247 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
255 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
258 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
255 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
251 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.64 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
257 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
250 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 
261 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
286 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.16 
 
 
258 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.04 
 
 
252 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
266 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
257 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 
251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  38.93 
 
 
257 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
255 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
254 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 
254 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
254 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
255 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
260 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
262 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
256 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
254 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.92 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  41 
 
 
254 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 
255 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
254 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.39 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.591331  normal  0.119727 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 
245 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
256 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
258 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
246 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
252 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  41.22 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
257 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
247 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
257 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
254 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
254 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.83 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.56 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.56 
 
 
246 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
255 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 
255 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
254 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>