More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3592 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.84 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 		 272 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.8 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.35 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.61 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.12 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12779  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.96 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0740489  normal  0.553244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.03 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 255 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  41.77 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.48 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 		 248 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.32 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  40.24 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 251 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  39.44 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 		 248 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.48 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.53 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 258 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1235  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183265  normal  0.0279411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.57 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>