More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2554 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 258 aa  508  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  49.59 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4321  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0523  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19521  normal  0.023029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.85 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2651  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1428  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6035  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0967664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  37.5 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  39 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0194596  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.7 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>